الببتيدات2

امثلة حول استنتاج التركيب الاولي للببتيد
مثال 2
ببت دٌ تٌالف من بقا اٌ 11 حامض ام نٌ كٌون ف هٌ الالن نٌ Ala هو الحامض الامبن ف النها ةٌ النتروج نٌ ةٌ , تم
تعر ضٌه الى انز مٌ التربس نٌ Trypsin واعطى القطع الببت دٌة الات ةٌ
Pro-Trp-Gly-Arg Ala-Glu-Phe-Asp-Lys Thr-Ser
تم تحل لٌ الببت دٌ الاصل مع انز مٌ ك مٌوتربس نٌ Chymotrypsin و اهطى القطع الببت دٌ ةٌ الات ةٌ :
Gly-Arg-Thr-Ser Ala-Glu-Phe Asp-Lys-Pro-Trp
الحل: ترتب القطع بطر قٌة تسمح لحذف الحوامض الام نٌ ةٌ المشتركة ف نفس التسلسل بالقطع و اشبة بعمل ةٌ الطرح العمودي و كما
اٌت .ً
Ala-Glu-Phe chymotrypsin fragment
Ala-Glu-Phe-Asp-Lys trypsin fragment
Asp-Lys-Pro-Trp chymotrypsin fragment
Pro-Trp-Gly-Arg trypsin fragment
Gly-Arg-Thr-Ser chymotrypsin fragment
Thr-Ser trypsin fragment
---------------------------------------------------------------- ------------------------------
Ala-Glu-Phe-Asp-Lys-Pro-Trp-Gly-Arg-Thr-Ser complete sequence
تسلسل كامل القطعة الببت دٌ ةٌ الاصل ةٌ مكونة من 11 حامض ام نًٌ
الون الاحمر شٌ رٌ الى حذف الحوامض الام نٌ ةٌ المتكررة ف القطع الببت دٌ ةٌ . *
يثال 3
ذثعا نهرحه مُ انحايض انكايم ,اعطد يكى اَخ انثثر ذُ ي انحىايض الاي حُُُ انران حُ :
Gly+Ala+2Cys+Arg+Glu+Ile+The+Phe+Val+NH4+
اخرزل انثثر ذُ الاصه تىاسطح ان شًكثرىا ثَا ىَل Mercaptoethanol , ثى تع هً حُ انكهح نثقا اَ انس سُرائ cysteine يع ىَد ذَ الاس رُ دُ iodoacetate , ا رَدد قطعر تثر ذُ حَ يرشاتح ) A و B (.اقرشذ انرشك ةُ
ان حًر مً نهثثر ذُ الاصه حسة ان عًهىياخ الاذ حُ :
انثثر ذُ A ( : a ( رَض انحىايض الاي حُُُ Ala+Gly+Cys+Glu+Arg+Ile+NH4+
( b ( عىيهد انثثر ذُ A يع ا زَ ىَ كاستىكس تثراد زَ carbocypeptidase A ا رَح ا زَون ىُس ي فُشد Ile
( c(عىيهد كزنك يع phenylisothiocyanate ( PITC ,كاشف اديا (ٌ ا رَح يشرق
انكلا سَ ) PTH-Glycine )
( d(عىيهد كزنك يع ا زَ ىَ انرشتس trypsin , ا رَدد تثر ذُ ) two peptides ( , احذه اً
ذحرى عه Glu+Ile+NH4+ , و ذحرى الاخشي عه Gly+Ala+Cys+Arg .
انثثر ذُ B (: e ( حَرى عه Thr+Val+Cys+Phe
( f ( ا رَح يعايهح انثثر ذُ B يع ا زَ ىَ carboxypeptidase A انحايض الاي فان Val تشكم
ي فُشد
امثلة حول استنتاج التركيب الاولي للببتيد
( g( يعايهح انثثر ذُ يع ك ىًُذشتس ا رَح كزنك فان ي فُشد Val و تثر ذُ ثلاث رَانف ي ثلاثح
حىايض اي حُُُ ه Cys+Thr+Phe
( h( ا رَح انركس شُ تىاسطح كاشف اديا عه PTH-Treonine .
انحم:
أ شَذثط كاشف اديا يع ان دً ىًعح الاي حُُُ انحشج نهسهسهح الاي حُُُ )ي خهح - N-terminal ( يكى اَ
يشرق PTH نهحايض الاي .
ب خَرزل انكاشف يشكثرىا ثَا ىَل - Mercaptoethanol الاصشج ث اُئ انسهف دُ disulfide bond .
خ عَ مً انكاشف ا ىَدو اس رُ دُ - iodoacetate ع هً حُ انكهح alkylation ان يداي عُ انثا ىَل SH نك عًَُها تعذ رنك ي الاكسذج Oxidation .
ز الايى اَُ )الايى ىَُو - NH4+ ( ان رًىنذ تعذ انرحهم انحايض ذَل عه وخىد يد ىًعح اي ذُ حَ amide ف احذ انحىايض الاي حُُُ , نزنك كَى انحايض الاي ان حًر مً هى انكهىذاي glutamine
ج كَى ذشك ةُ انثثر ذُ ك اً ثَذو ف انشكم الاذ -
(A)
H3N+ Gly Ala Cys Arg Glu NH2 Ile COO-
S
S
(B)
NH3+ Thr Cys Phe Val COO-
اسئلة
تمر نٌ 1
ببت دٌ تٌالف من بقا اٌ 11 حامض ام نٌ , الكلا سٌ نٌ هو الحامض الام نٌ عند طرف النتروج نٌ N-terminal , اعطت القطع الببت دٌ ةٌ التال ةٌ عند معاملة الببت دٌ الاصل الى هظم انز مٌ
التربس نٌ
Ser-Phe-Val-Leu-Lys ; Ala-Phe-Ser-Lys ; Gly-Ala-Thr-Arg ;
and Ile-Trp-Glu-Thr-Ser. PITC Trypsin Carboxypeptidase A Mercaptoethanol Carboxypeptidase A And Chymotrypsin PITC
امثلة حول استنتاج التركيب الاولي للببتيد
كذلك تم تعرضٌ الببت دٌ السل مٌة )الاصل ةٌ (الى هظم انز مٌ ك مٌوتربس نٌ chymotrypsin ,
اعطت اربع قطع ببت دٌ ةٌ الات ةٌ :
Ser-Lys-Ile-Trp ;Gly-Ala-Thr-Arg-Ser-Phe ; Glu-Thr-Ser
and Val-Leu-Lys-Ala-Phe.
اقترح ترك بٌ الببت دٌ الاصل .
تمر نٌ 2
سلسلت نٌ ببت دٌ ةٌ تحتوي على اكثر من جسر سلف تٌ sulfide bridge , الاطراف النتروج نٌ ةٌ
للببت دٌات هما الفال نٌ Val و البرول نٌ Pro .كسرت الجسور السلفات ةٌ بواسطة performic acid مكون بقا اٌ اثن نٌ من cystic acid ( Cys.SO3H (الت تكونت من بقا اٌ الس سٌت نٌ
cysteine . و بتتابع التحل لٌ مع انز مٌ التربس نٌ trypsin تكونت القطع الات ةٌ:
Val-Ser-Lys ; Pro-Arg ; Glu-Trp-Cys.so3H-Gly ; Cys.SO3H-Leu-Tyr-Cys.SO3H-Arg ; Gly-Cys.SO3H-Phe-Ile-Ala
و بتعرضٌ الببت دٌات الاصل ةٌ الى الببس نٌ pepsin و اتبع بالمعاملة مع per formic acid
اعطت القطع الببت دٌ ةٌ الات ةٌ :
Val-Ser-Lys-Cys.SO3H-Leu; Ile-Ala ; Pro-Arg-Gly-Cys.SO3H-Phe
Trp- Cys.SO3H-Gly ; Tyr-Cys.SO3H-Arg-Glu.
استنتج الترك بٌ للببت دٌات الاصل ةٌ
امثلة حول استنتاج التركيب الاولي للببتيد